Main content

Alert message

התמחות בביואינפורמטיקה

את ההתמחות ניתן לעשות כחלק מהלימודים לתואר שני בכל אחד מהחוגים הביולוגיים: ביולוגיה אבולוציונית וסביבתית, ביולוגיה של האדם, ביולוגיה ימית, או נוירוביולוגיה. ההתמחות בביואינפורמטיקה כוללת 9 שש"ס של קורסי חובה וחובת-בחירה (אבל שימו לב גם לחובת לימוד תכנות). במקביל ילמדו הסטודנטים קורסים מהחוג הרלוונטי ובהתאם לדרישות מסלול הלימודים של אותו חוג. כמו כן, ניתן לקחת קורסי בחירה בביואינפורמטיקה, שיספרו במניין השש"ס הכולל לתואר. הרכבת תכנית הלימודים תהיה בתיאום עם המנחה של עבודת הגמר ודורשת את אישור המנחה והחוג של הסטודנט/ית.

שימו לב! הקורסים של תכנית ההתמחות באים במקום חלק מקורסי הבחירה בתכנית של החוג. לדוגמה, אם התכנית של חוג מסויים דורשת 30 שש״ס בסך הכל, אז הקורסים של הביואינפורמטיקה יכולים להכלל במניין של ה-30 (לפחות בחלקם, תלוי בדרישות התכנית של החוג).

קורס חובה

קורס מבוא אחד הינו חובה לכלל הסטודנטים בתכנית:

שם הקורס

מרצה

היקף

מס' קורס

שיטות מחקר בביואינפורמטיקה

מיקי קוזלוב, איל פריבמן

4 שש"ס

221.4425

סטודנטים שלא לא למדו קורס תכנות אחד לפחות במסגרת לימודים קודמים ידרשו להשלים במסגרת קורסי הבחירה (לא יספר בחובת-בחירה) אחד מקורסי התכנות הבאים:

תכנות ב Python

אמיר כהנים

3 שש"ס

221.4433

תכנות ב MATLAB

שני שטרן

3 שש"ס

 

קורסי חובת-בחירה

נדרשות 5 שש"ס לפחות מתוך הרשימה הבאה:

שם הקורס

מרצה

היקף

מס' קורס

אלגוריתמים בגנומיקה חישובית

שגיא שניר

3 שש"ס

221.4424

בקרת גנים במהלך התפתחות עוברית ובאבולוציה (פעם בשנתיים) סמדר בן טאבו דה-לאון 2 שש"ס 227.4018
סטטיסטיקה בשפת R אבי בר מסדה 3 שש"ס 221.5408
מיפוי גנומי
איל פריבמן 2 שש"ס

221.4406

מיקרוביולוגיה ימית
דניאל שר 2 שש"ס

227.4006

סמינר מחקר בביולוגיה כמותית ומודלים
דניאל שר 2 שש"ס

סדנה בביואינפורמטיקה (שבוע מרוכז בפברואר)
דניאל שר, איל פריבמן

3 שש"ס

 

שיטות הסתברותיות בגנומיקה

שגיא שניר

3 שש"ס

221.4420

יסודות האבולוציה המולקולרית איל פריבמן 2 שש"ס

221.4412

שעונים ביולוגיים ערן טאובר 2 שש"ס 221.4023
אבולוציה מיקרוביאלית שרית אברני 2 שש"ס 221.4022

 

סדנה מרוכזת בביואניפורמטיקה

כל שנה בחופשת הסמסטר נלמד סדנה מרוכזת בביואינפורמטיקה לאורך שבוע (חמישה ימים מלאים).

8-12/2/2015: Workshop on Environmental Genomics and the Human Microbiome
סדנא על ריצוף גנומי של דוגמאות סביבתיות (בשיטות Next Generation Sequencing) וניתוח של נתונים מסוג זה לצורך השוואת ביטוי גנים.

21-25/2/2016: Transcriptomics workshop
סדנא על ריצוף רנ״א (בשיטות Next Generation Sequencing) וניתוח של נתונים מסוג זה לצורך השוואת ביטוי גנים.

5-9/2/2017: Workshop on omics of non-model organisms
סדנא על ריצוף גנומי של מינים חדשים (בשיטות Next Generation Sequencing) הרכבת הרצפים (assembly) וזיהוי גנים (annotation).

18-22/2/2018: Workshop on statistics and data visualization for omics
סדנא על אנליזות סטטיסטיות והצגת גרפית של נתונים מריצוף גנומי/טרנסקריפטומי/מטה-גנומי (בשיטות Next Generation Sequencing).

17-21/2/2019: Workshop on omics of omics of environmental and host-associated microbiomes
סדנא על ריצוף גנומי של דגימות מיקרוביאליות מהסביבה או מגופם של מאחסנים (בשיטות Next Generation Sequencing) ניתוח הרצפים ואנליזות סטטיסטיות.

* לפרטים ניתן לפנות לאיל פריבמן ודניאל שר.